答案：D

题目分析：根据复分解反应的条件，离子间若能互相结合成沉淀、气体或水，则离子不能共存，即不能共存的离子不能存在于同一工厂的废水中。假设氢离子来自甲厂，则能与氢离子结合生成水分子的氢氧根离子必须来自乙厂。能与氢氧根离子结合生成氢氧化铜沉淀的铜离子得来自甲厂，分析给出的五种离子，确定甲厂的离子有氢离子、铜离子和硝酸根离子，乙厂的离子有钾离子、硝酸根离子和氢氧根离子，分析选项，答案选D。