A、石英光导纤维的主要成分为二氧化硅，含有二氧化硅，故A错误；

B、计算机芯片的主要成分为单质硅，不含有二氧化硅，故B正确；

C、玻璃的主要成分为硅酸钠、硅酸钙以及二氧化硅，含有二氧化硅，故C错误；

D、玛瑙的主要成分为二氧化硅，含有二氧化硅，故D错误；

故选：B．