答案：C

题目分析：A、分子由原子构成，但是分子不一定比原子大，不正确；

B、原子核包括质子和中子，但并不是所有的原子核都含有中子，如氢原子核内没有中子，错误；

C、元素的化学性质跟原子的最外层电子数关系最密切，正确；

D、电子是最小的粒子，质量可以忽略不计，错误。

故选C

点评：掌握分子、原子以及其内部构成是解决本题的关键。