参考答案：B

解析：[考点] 二审裁判 根据《民事诉讼法》第153条的规定，第二审人民法院对上诉案件，经过审理，按照下列情形，分别处理：(1)原判决认定事实清楚，适用法律正确的，判决驳回上诉，维持原判决；(2)原判决适用法律错误的，依法改判；(3)原判决认定事实错误，或者原判决认定事实不清，证据不足，裁定撤销原判决，发回原审人民法院重审，或者查清事实后改判；(4)原判决违反法定程序，可能影响案件正确判决的，裁定撤销原判决，发回原审人民法院重审。据此，本题中市中级人民法院审理某公司上诉案时，发现一审法院认定事实清楚，但适用法律错误，应当依法改判，故B项为最合题意的选项。