答案：D

题目分析：根据常见物质的微观结构分析判断。

A、氯化钠是由钠离子和氯离子构成的，错误；

B、蒸馏水是由水分子构成的，错误；

C、氮气是由氮分子构成的，错误；

D、金刚石是由碳原子直接构成，正确。故选D

点评：本题考查物质的构成，学生应熟悉常见的物质及它们的构成微粒，并能进行归纳总结来掌握物质的构成。