（1）全等三角形面积相等，但面积相等的两个三角形不一定是全等三角形，故此选项是假命题；

（2）全等三角形的对应边相等，对应角相等，是真命题，不符合题意，

（3）三角形任意一边的两个端点到这边上的中线的距离相等，是真命题，不符合题意，

（4）有两边及其中一边上的高对应相等的两个三角形不一定全等，

如图：△ABC和△ACD，的边AC=AC，BC=CD，高AE=AE，

但△ABC和△ACD不全等，故此选项是假命题；

（5）根据角平分线的性质可得出，三角形的三条角平分线相交于一点，这点到三角形三边的距离一定相等，是真命题，不符合题意．

故假命题有2个．

故选：B．