A  

题目分析：句意：虽然我们实施计划的时候很难，但是最后是有回报的。分析句子可知the great difficulty是先行词，后面是省略关系代词的定语从句，在定语从句中the great difficulty做宾语，所以用的是词组：have the great difficulty （in） doing，这里省略了in，所以选A。