答案：D

题目分析：某气体通入紫色石蕊试液，紫色石蕊试液变红，说明该气体能与水反应生成酸，是酸性气体，酸性气体除二氧化碳外还有二氧化硫，A除去；分子由原子构成，只能说分子比构成它的原子大，但其他的分子和原子不能如此比较，B错误；干冰是固体的二氧化碳，两者是同种物质，C错误；一个二氧化碳分子是由一个碳原子和两个氧原子构成的，共含有三个原子，D正确。故选D。