A、根的作用是固定植物体、吸收水分和无机盐．A错误．

B、茎的作用是支持和输导，不能进行光合作用．B错误．

C、花的功能是结出果实，不能进行光合作用．C错误．

D、光合作用的场所是叶绿体，因此绿色植物进行光合作用只在含有叶绿体的部位进行，叶片由表皮、叶肉和叶脉组成，叶肉细胞中含有大量的叶绿体，是进行光合作用的主要部位；幼嫩茎的绿色部位也能进行光合作用，因此绿色植物进行光合作用的主要器官是叶．D正确．

故选：D