A、-3与-

1

3

符号相同，不是互为相反数，所以A选项错误；

B、|-3|=3，所以B选项错误；

C、-|-3.5|=-3.5，所以C选项错误；

D、|-

1

3

|=

1

3

，-

1

3

与|-

1

3

|互为相反数，所以D选项正确．

故选D．