A、对顶角相等，是真命题，故此选项不符合题意；

B、∵两个不相等的角互为补角，

∴这两个角一个角大于90°，一个角小于90°，

即一个锐角，一个钝角，故互为补角的两个角都是锐角，是假命题，故此选项符合题意；

C、如果两条直线都和第三条直线平行，那么这两条直线也互相平行，根据平行线的性质得出，是真命题，故此选项不符合题意；

D、两条直线被第三条直线所截，如果内错角相等，那么这两条直线平行，根据平行线的性质得出，是真命题，故此选项不符合题意；

故选：B．