（1）从图中看出，在适宜温度条件下，一段时间以后，A烧杯不加水，在B烧杯中加入了少量水，变量是水，因此探究的是水分对种子萌发的影响；在B烧杯中加入了少量水，在C烧杯中加入了较多的水，C烧杯注入清水完全浸没种子，所以种子缺少空气，因此BC的变量是空气，因此探究的是空气对种子萌发的影响．所以小明提出的假设是种子的萌发需要适量的水分、充足的空气．

（2）A烧杯不加水，在B烧杯中加入了少量水，在C烧杯中加入了较多的水，使种子完全浸入水中，并在水面上覆盖了一层油．（以上实验是25℃的实验室内完成的）．A烧杯不加水，种子缺少水分，所以种子不萌发；在B烧杯中加入了少量水，满足了种子萌发的外界条件为充足的空气、适量的水分、适宜的温度，种子萌发；在C烧杯中加入了较多的水，使种子完全浸入水中，并在水面上覆盖了一层油，所以种子缺少空气，不能萌发．

（3）小明在实验中设计了两个对照实验．其中，B与A的实验对照，变量是水分，主要探究水分是种子萌发的外界条件．

故答案为：

（1）适量的水分、充足的空气；

（2）B；

（3）水分．