（1）连接⑤胚芽和⑥胚根的结构④的名称是胚轴，胚轴与子叶相连．

（2）玉米种子的营养物质储存在①胚乳中，主要是淀粉，而遇碘变蓝是淀粉的特性．因此往玉米种子纵切面上滴一滴碘液，则变成蓝色的结构是①胚乳．

种子主要包括种皮（具有保护作用）和胚、及胚乳（只有部分植物的种子含有），其中胚又包含①胚根将来发育成根②胚轴将来发育成连接根与茎的部分③胚芽将来（3）玉米种子的种皮和果皮紧密连在一起，具有保护胚的作用，因此能保护种子结构的②的名称是果皮和种皮．

故答案为：

（1）胚轴

（2）胚乳

（3）果皮和种皮