A、正丁烷与异丁烷的分子式相同，烷烃即分子内碳原子的连接方式不同，则结构不同，二者互为同分异构体，故A正确；

B、因结构不同，则性质不同，但都属于烷烃，化学性质相似，但不能作为互为同分异构体的依据，故B错误；

C、因二者的结构不同，为不同的物质，则物理性质不同，故C错误；

D、二者的结构不同，都属于烷烃，具有相似的空间结构，但不能作为互为同分异构体的依据，故D错误．

故选A