参考答案：A

解析：

全面替换意味着所有商店同时实施新系统，这就排除了将新系统和老系统的结果进行比较的可能性。公司也不可能有在所有商店立刻实施新系统所需要的人力。选项(b)不正确，因为阶段性实施意味着新系统将分阶段实施。考虑到新系统的集成特性，阶段性实施不可行。选项(c)不正确，因为并行运行意味着老系统和新系统同时运行一段时间。商店的员工不可能有时间同时运行两个程序。选项(d)不正确，因为在一个或少数几个商店进行试运行将使得公司能够评估新系统，根据试运行结果修改系统，然后在所有商店实施改进后的系统。