参考答案：D

解析：关于商标撤销权制度，法律规定较为复杂。按照我国《商标法》第四十一条的规定，可行使商标撤销权的情形包括：(1)已经注册的商标，违反《商标法》第十条、第十一条、第十二条规定的禁用性条款的规定。(2)以欺骗手段或者其他不正当手段取得注册的。(3)已经注册的商标，违反《商标法》第十三条、第十五条、第十六条规定的禁用性条款和第三十一条关于保护在先权利的规定，自商标注册之日起5年内，商标所有人或者利害关系人可以请求商标评审委员会裁定撤销该注册商标。对恶意注册的驰名商标所有人行使撤销权不受5年的时间限制。商标权一经撤销，其商标专用权视为自始不存在。根据上述规定，对于不得作为商标使用的标志、三维商标以及恶意注册驰名商标的撤销权没有时间限制；而对于《商标法》第十三条规定的情形、越权代理注册商标、非来源于标示地区的地理标志以及违反保护在先权利规定的商标，利害关系人主张撤销的，要受到5年撤销权的时间限制。综上分析，缺乏显著特征属于不得作为商标注册的情形，撤销权不受5年时间的限制，因此，排除A项。三维商标撤销权不受5年时间限制，因此，排除B项。恶意注册驰名商标不受5年时间限制，因此，排除C项。越权代理注册驰名商标的，要受到5年撤销权时间的限制，可见，D项是正确答案。