通过分析知道绿色开花植物的六大器官中花、果实和种子是生殖器官．

A：根是植物的营养器官，故不合题意；

B：花是植物的生殖器官，故合题意；

C：叶是植物的营养器官，故不合题意；

D：茎是植物的营养器官，故不符合题意．

故选：B．