参考答案：E

解析：在流行病学实验研究中，评价疫苗接种效果主要包括两个内容：疫苗接种的流行病学效果和免疫学效果。前者主要用效果指数和保护率，后者主要用抗体阳转率和抗体几何平均滴度指标。本题其余备选答案不是评价疫苗接种效果的内容，但属于考核免疫工作的内容。