传染病流行的时候，只要切断传染病流行的三个环节中的任何一个环节，传染病就流行不起来；因此预防传染病的一般措施有控制传染源、切断传播途径、保护易感人群；选项中，加强体育锻炼和注射流感疫苗 属于保护易感人群．  消灭苍蝇、蟑螂、老鼠等有害动物 属于控制传染源，不吃腐败变质的食物属于预防传染病的切断传播途径的措施．
故选：B