答案：C

A、由于水中含有水分子，氯化钠溶液中含有氯离子，这两种物质都不能使石蕊试液变红，说明水分子和氯离子不能使石蕊试液变红，从而说明稀盐酸中使紫色石蕊试液变红的粒子是氢离子，故A正确；

B、向滴有紫色石蕊试液的稀盐酸中滴加氢氧化钠溶液，溶液中的粒子发生了改变，水分子和氯离子都没有变化，氢离子没有了，溶液由红色变成了紫色，说明溶液颜色的变化和氢离子有关，故B正确；

C、由于该实验设计只是验证了氢离子和钠离子与石蕊试液混合时的变色情况，并没有证明水分子的情况，故C错误；

D、由于该实验分别设计了水、硝酸钠溶液不能使石蕊试液变红，说明水分子和钠离子不能使石蕊试液变红，稀盐酸和稀硫酸都能使石蕊试液变红，从而说明了氢离子使石蕊试液变红的，故D正确．

故选C．