参考答案：E

解析：根分叉病变的主要病因是菌斑微生物，所以E选项正确。咬合创伤是加重因素，所以A选项错误。根柱过短易患根分叉病变，所以B选项错误。磨牙症可造成硬组织损害，但是一般与根分叉病变无关，所以D选项错误。龋病一般与根分叉病变无关，所以C选项错误。故本题选E。