参考答案：B

解析：本题考查的是抵押权的顺位以及抵押权的消灭问题。通常抵押权的顺序是按照抵押权登记的顺序为准，故A项错误。当债权人和债务人合并时，此时产生了债权人和债务人变成了一个人，这就是混同，因此，B项是正确的。通常而言，债权消灭，抵押权也随之消灭，但是同一物的所有权与他物权归属于一人时，如果对于所有人有法律上的利益，或者对于第三人有法律上利益，他物权就不因混同而消灭，此时的抵押权仍然存续。对于这一点，我国《担保法解释》第77条有明确的规定。这一规定主要是为了保护债权人不会因为合并而遭受不利后果。更为重要的是，此时的抵押权并不是为了担保债权的，而是为了对抗后一次序的抵押权人，故C项是错误的。因此，乙的抵押权担保范围仍然是在第一抵押权后的剩余部分，在本案中就是50万元，而不是100万元，故D项是错误的。