A、使全球气候变暖的主要气体二氧化碳，是化石燃料燃烧生成的，故有关系；

B、热污染与化石燃料的燃烧有关，故有关系；

C、大气污染是化石燃料燃烧生成的二氧化硫、一氧化碳、可吸入颗粒造成的，故有关系；

D、赤潮现象的形成是化肥、含磷洗涤剂的大量使用，造成的水体污染的结果，与化石燃料燃烧没有关系．

故答案为：D．