答案：C

题目分析：句意为：如果我那时学的是科学，而不是文学，那么我也许能帮助你。虚拟语气的用法是从句的谓语动词要在主句的谓语动词的基础上往后退一个时态。即如果句子主句是一般式，那么从句就要用过去式。但在这个句子中，主句是对现在事实的说明，所以使用一般现在时。而then一词说明是与过去事实相反，所以从句应该使用过去完成时，选C。