A、用石墨做铅笔芯是利用了石墨的硬度小，属于物理性质．故A错误；

B、冬天用木炭生火取暖是利用木炭燃烧生成二氧化碳，放出了大量的热，有新物质生成，属于化学性质．故B正确；

C、用金刚石裁玻璃利用了金刚石的硬度大，属于物理理性质．故C错误；

D、用活性炭除去冰箱中的异味是利用活性炭疏松多孔结构，把异味吸附在表面，没有新物质生成，属于物理性质．故D错误．

故选B．