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题目分析：考查主谓一致。本题属于主谓一致里特殊用法large quantities of的后面既可以接可数名词也可以接不可数名词，谓语动词都使用复数形式。句意：—为什么这个湖闻起来很臭？—因为大量的水都已经被污染了。根据句意说明使用被动语态。而且是已经被污染了，也要使用现在完成时的形式。故D正确。

点评：特殊的考查点：large quantities of的后面既可以接可数名词也可以接不可数名词，谓语动词都使用复数形式。