A、卢瑟福的原子核式结构学说能很好地解释α粒子散射实验事实，A正确；

B、放射性元素发生β衰变时所释放的电子来源于中子转化为质子后产生的电子，B错误；

C、氢原子吸收一个光子跃迁到激发态后，再向低能级跃迁时放出光子的频率有多种，C错误；

D、分别用X射线和紫光照射同一金属表面都能发生光电效应，X射线的频率大，则用X射线照射时光电子的最大初动能较大，D正确；

E、衰变时有质量亏损释放出能量，所以衰变前Th核质量大于衰变后Pa核与β粒子的总质量，E正确；

故选ADE