A、原始大气中有氢、甲烷等气体，不含有氧气，没有生命．故不符合题意；

B、始祖鸟保留了爬行类的许多特征，例如嘴里有牙齿，而不是形成现代鸟类那样的角质喙；指端有爪等；但是另一方面，始祖鸟又具有鸟类的一些特征，如已经具有羽毛，在一些骨骼形态上也表现出一些鸟类特征或过渡特征，如它的第三掌骨已经与腕骨愈合．因此始祖鸟可以证明鸟类与爬行类之间存在一定的亲缘关系．故不符合题意；

C、现代人类是由森林古猿经过长期自然选择进化而来的．故符合题意；

D、生物进化的总趋势是由简单到复杂、由低等到高等、由水生到陆生．故不符合题意．

故选C．