（1）、动物类群1是哺乳类，其繁殖方式最主要的特征是胎生哺乳．植物类群3是裸子植物，能产生种子，用种子繁殖后代，适应环境的能力强，适于生活在干旱的陆地上，植物类群4是蕨类植物，不结种子，用孢子繁殖后代，属于孢子植物，孢子的生命力较低，适应能力较差，因此比种子植物低等．动物类群5是鸟类，其特有的呼吸方式是双重呼吸，提高了气体交换的效率，能为鸟类飞行提供充足的氧气．

（2）、在分类上，该进化树的两大主干代表的分类等级是植物界和动物界．

故答案为：（1）胎生哺乳；用种子繁殖；双重呼吸   

（2）界