A、蜡烛燃烧生成二氧化碳和水，有新物质生成，属于化学变化，故A错；

B、高温煅烧石灰石生成氧化钙、二氧化碳，有新物质生成，属于化学变化，故B错；

C、纸里包不住火是物质燃烧，有新物质生成，属于化学变化，故C错；

D、玉不琢不成器只是形状发生了变化，没有新物质生成，属于物理变化，故D正确．

故选D．