A、大理石的主要成分是碳酸钙，属于盐，故A错误；

B、磷矿石的主要成分是磷酸钙，属于盐，故B错误；

C、金刚石是由C元素组成的原子晶体，为单质，故C错误；

D、石英的主要成分是二氧化硅，由硅元素和氧元素两种元素组成，属于氧化物，故D正确．

故选D．