A、由于二氧化硫和二氧化碳是纯净物，只含氧原子不含氧分子，所以A选项错误；

B、氧元素的质量分数：二氧化硫和二氧化碳中氧元素的质量分数分别为

16×2

64

×100%=50%，

16×2

44

×100%≈72.7%，所以B选项错误；

C、N个二氧化碳分子中含2N个氧原子，N个二氧化硫分子中含2N个氧原子，所以含氧原子数相同，所以C选项正确；

D、二氧化硫的相对分子质量为16×2+32=64，二氧化碳的相对分子质量为16×2+12=44，所以D选项错误．

故选C．