（1）菜豆种子和玉米种子的结构的异同为：

（2）在种子的萌发过程中，胚芽发育成茎和叶、胚轴发育成连接茎和根的部分、胚根发育成根、子叶转运营养物质或储存营养物质作用．（3）菜豆种子的结构包括胚根、胚芽、胚轴、子叶和种皮．种皮起保护作用，胚芽将来发育成茎和叶，胚芽将来发育成根，胚轴将来发育成连接根和茎的部位．种子萌发时，胚的胚根，首先生长伸长，突出种皮发育成幼根，与此同时，子叶以下的胚轴迅速生长，发育成白色幼嫩的连接根与茎的部位，而两片子叶夹着的胚芽几乎没有什么明显的生长．我们吃的豆芽主要是白色的部分，即胚轴．故答案为：（1）种皮；胚；子叶；胚芽；胚轴；胚根；（2）胚芽；（3）胚轴