种子在萌发过程中所进行的一系列复杂的生命活动，是需要能量的．只有种子不断地进行呼吸，从外界获得氧气，进行呼吸作用，释放能量，才能保证生命活动的正常进行和种子的正常萌发，所以种子在萌发初期，进行的主要生理活动是呼吸作用．

故选B