种子的萌发不仅需要适宜的温度、适量的水分和充足的空气等外部条件，而且种子本身必须具有完整的、有活力的胚以及供胚发育的营养物质．完全浸没在水中的种子不易萌发，主要原因是缺乏空气．种子不能进行呼吸作用，无法将存储的有机物转化成萌发所需的物质，无法获得能量，因此不能萌发．

故答案为：不能，主要原因是缺乏空气．