A、分子的运动速度加快了，分子的种类没有变，没有新物质生成，属于物理变化．故A不符合题意；

B、由一种分子变成另一种分子，分子的种类发生了变化，有新物质生成，属于化学变化．故B符合题意；

C、分子之间的间隔变小了，分子的种类没有变，没有新物质生成，属于物理变化．故C不符合题意；

D、一种物质的分子运动到另一种物质的分子之间去，分子的种类没有变，没有新物质生成，属于物理变化．故D不符合题意．

故选B．