从水库取水、通过过滤池、通过活性炭吸附池等过程中没有新物质生成，属于物理变化；

投药消毒的过程中，一般是向水中加入氯气，氯气能和水反应生成盐酸和次氯酸，属于化学变化．正确．

故选D．