A、沼气燃烧的过程中沼气的主要成分甲烷和氧气反应生成二氧化碳和水，有新物质生成，属于化学变化．故选项错误；

B、剩饭变馊的过程中有对人体有害的新物质生成，属于化学变化．故选项错误；

C、动物的呼吸作用的过程中有新物质二氧化碳等生成，属于化学变化．故选项错误；

D、瓷碗破碎的过程中只是形状发生改变，没有新物质生成，属于物理变化．故选项正确．

故选D．