A、石油分馏是简单的物理分离，没有生成新物质，是物理变化，故A错误；

B、净化水是通过物理方法分离，没有生成新物质，故B错误；

C、蒸发食盐水，只是食盐水中的水分蒸发，没有生成新物质，故C错误；

D、蜡烛燃烧，有二氧化碳生成，发生了化学变化，故D正确；

故选D．