A、冷却硝酸钾的热饱和溶液有硝酸钾晶体析出的过程中没有新物质生成，属于物理变化．错误；

B、浓硝酸易挥发，挥发出的硝酸和水结合成硝酸小液滴，过程中没有新物质生成，属于物理变化．错误；

C、氢氧化钠溶液使酚酞试液变红色的过程中，不能证明分子在化学反应中是可以再分的．错误；

D、给水通电时，水分子分解成氢原子和氧原子，氢原子再结合成氢分子，氧原子再结合成氧分子，过程中能够证明分子在化学反应中是可以再分的．正确．

故选D．