A、种子萌发的营养物质来源于种子本身，而不是来自土壤中，为错误项．

B、玉米种子中的营养物质存在与胚乳中，子叶中没有营养物质，故错误．

C、玉米的营养物质储存在胚乳里，所以玉米种子萌发的营养物质来自于胚乳，故正确．

D、种子萌发的营养物质来源于种子本身，而不是来自叶的光合作用中，种子在萌发时还没有长出叶，故为错误项．

故选C．