变异包括可遗传的变异和不可遗传的变异，由遗传物质决定的变异是可遗传的变异；由环境因素引起的变异，由于遗传物质没有发生改变，这种变异不能传给下一代，是不可遗传的变异；

A、同一品种的花生大小有差异是环境因素引起的，说明变异是普通存在的．故不符合题意；

B、大花生品种中的小花生只占少数，是环境因素形成的变异，说明性状受环境影响较小，主要还是遗传物质起决定作用．故不符合题意；

C、大小两个花生品种的差异是因遗传物质不同而形成的．而小花生品种的大花生的遗传物质并没有改变，种在地里不一定会结出大花生．故符合题意；

D、大小两个花生品种的差异是因遗传物质不同而形成的，基因决定生物的性状，因此花生品种的差异是由不同的基因决定的．故不符合题意．

故选C