参考答案：B

解析： 2004年全部工业增加值是1044.8亿元，大中型企业的增加值是408.54亿元，故在2004年中大型企业的增加值占全部工业增加值的比重是408.54÷1044.8×100%=39.1%，正确答案为B项。