因为每户居民的子女都不超过两个，一部分家庭有一个孩子，

所以另一部分或者有两个孩子，或者没有孩子；

而余下的家庭的一半每家有两个孩子，所以另一半没有孩子，

因此，全镇平均每个家庭有一个孩子，5000个家庭应有5000个孩子．

故答案为：5000．