D。

根据有理数乘方，合并同类项，幂的乘方与积的乘方，同底数幂的除法运算法则逐一计算作出判断：

A、（﹣2）²=4，故此选项错误；

B、a²、a³不是同类项，不能合并，故此选项错误；

C、（3a²）²=9a⁴，故此选项错误；

D、x⁶÷x²=x⁴，故此选项正确。

故选D。