答案：D

题目分析：如图可知Ⅰ到Ⅳ的逻辑关系是：Ⅰ包含Ⅱ包含Ⅲ包含Ⅳ，Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ的关系是并列。

A鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类中各项是并列关系故A错误。

B、Ⅰ染色体、ⅡDNA、Ⅲ基因、是包含关系Ⅳ细胞核包含Ⅱ、Ⅲ、Ⅰ，故B错误。

CⅠ种子、包含Ⅱ胚包含Ⅲ子叶与Ⅳ种皮并列，故C错误

D项中I微生物包括II病毒、III细菌、IV真菌，且病毒、细菌、真菌是并列关系，与图示相符。故D正确。