（1）二；一 （2）胚 （3）子叶；胚乳

题目分析：：（1）菜豆种子和玉米种子都包括种皮和胚，胚是种子的重要部分，都包括胚芽（将来发育成茎和叶）、胚轴（将来发育成连接茎与根的部分）、胚根（将来发育成根）和子叶四部分．二者最主要的不同是子叶的数目（菜豆种子的子叶2片；玉米种子的子叶1片）、营养物质的贮存结构（菜豆种子的营养物质储存在子叶中；玉米种子的营养物质储存在胚乳中）、有无胚乳等（菜豆种子没有胚乳）．故答案为：（1）二；一（2）胚（3）子叶；胚乳