答案：B

题目分析：通过图中内容分析可知，

A、1号和3号都不具备种子萌发的条件，有两个变量，都不萌发，因此没有对照组，不能形成对照实验，不符合题意；

B、1号与2号存在唯一的变量--水分，其它因素都相同，探究的问题是水分对种子萌发的影响，根据对照实验的变量的唯一性来看，本实验探究的是水分对种子萌发的影响，符合题意；

C、2号和3号存在的变量是空气，探究的是空气对种子萌发的条件，不符合题意；

D、2号和4号对照，探究的是温度对种子萌发的影响，不符合题意；

故选B。