A、食物腐败有菌类物质生成，属于化学变化，故A错；

B、矿石粉碎只是形状发生了变化，没有新物质生成，属于物理变化，故B正确；

C、钢铁生锈生成了一种红棕色的新物质铁锈，主要成分是氧化铁，所以有新物质生成，属于化学变化，故C错；

D、煤的燃烧生成二氧化碳、二氧化硫等新物质，属于化学变化，故D错．

故选B．