首先我们知道遇碘液成蓝色的物质是淀粉，然而作为玉米种子的营养物质（淀粉）主要储存在胚乳中．玉米种子结构如图：

因此，把碘液滴在玉米种子的纵切面上，染成蓝紫色的部分是胚乳．

故选B